L’OFAE et l’organisation de milice s’articulent autour des six domaines que sont l’énergie, l’alimentation, les produits thérapeutiques, la logistique, les technologies de l’information et de la communication (TIC) et l’industrie – désignés comme secrétariats au sein de l’office et domaines dans l’organisation de milice. L’OFAE dispose en outre d’une section Stockage.
La section Stockage et les secrétariats sont rattachés à l’OFAE sur le plan administratif. Les chefs de ces unités sont membres de la direction de l’office. Les chefs de secrétariats sont subordonnés, sur le plan professionnel, aux responsables des domaines de l’AEP.
L’OFAE s’occupe de toutes les questions administratives de l’AEP et supervise le stockage obligatoire. Il coordonne en outre la collaboration entre les services fédéraux concernés, l’armée et la protection de la population, et a pour tâche d’informer la population.
